Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEFVO15553 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEFVO15553 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEFVO15553 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEFVO15553 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEFVO15553 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MEFVO15553 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MEFVO15553 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEFVO15553 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEFVO15553 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEFVO15553 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEFVO15553 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEFVO15553 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEFVO15553 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEFVO15553 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MEFVO15553 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEFVO15553 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEFVO15553 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEFVO15553 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEFVO15553 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEFVO15553 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEFVO15553 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MEFVO15553 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEFVO15553 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEFVO15553 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MEFVO15553 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEFVO15553 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEFVO15553 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEFVO15553 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEFVO15553 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEFVO15553 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MEFVO15553 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEFVO15553 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEFVO15553 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEFVO15553 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEFVO15553 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEFVO15553 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MEFVO15553 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEFVO15553 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEFVO15553 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEFVO15553 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEFVO15553 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MEFVO15553 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEFVO15553 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEFVO15553 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEFVO15553 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEFVO15553 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEFVO15553 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MEFVO15553 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEFVO15553 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MEFVO15553 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MEFVO15553 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MEFVO15553 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEFVO15553 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEFVO15553 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEFVO15553 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEFVO15553 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEFVO15553 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEFVO15553 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEFVO15553 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEFVO15553 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEFVO15553 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MEFVO15553 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEFVO15553 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEFVO15553 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEFVO15553 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms