Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GIPC1O14908 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIPC1O14908 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms