Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXN3O00409 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXN3O00409 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXN3O00409 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXN3O00409 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXN3O00409 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXN3O00409 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms