Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRE1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QRE1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QRE1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QRE1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QRE1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QRE1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QRE1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QRE1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QRE1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QRE1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QRE1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QRE1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QRE1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QRE1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QRE1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QRE1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
J3QRE1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
J3QRE1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QRE1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QRE1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QRE1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QRE1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QRE1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QRE1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QRE1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QRE1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QRE1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QRE1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QRE1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QRE1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QRE1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QRE1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QRE1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QRE1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QRE1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QRE1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QRE1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QRE1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QRE1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QRE1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QRE1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QRE1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QRE1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QRE1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QRE1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QRE1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QRE1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QRE1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QRE1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QRE1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QRE1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QRE1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QRE1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QRE1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QRE1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QRE1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QRE1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QRE1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.8 ms