Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms