Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NACAE9PAV3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NACAE9PAV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms