Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BECN2A8MW95 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN2A8MW95 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms