Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINE3A8MV23 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms