Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMF1-BGLAPU3KQ54 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms