Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
LAMC3Q9Y6N6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
LAMC3Q9Y6N6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC42.48■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
LAMC3Q9Y6N6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.4■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
LAMC3Q9Y6N6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
LAMC3Q9Y6N6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC42.27■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC42.27■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
LAMC3Q9Y6N6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms