Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC6Q9Y625 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms