Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NR2E3Q9Y5X4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E3Q9Y5X4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2E3Q9Y5X4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms