Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRPC5Q9UL62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRPC5Q9UL62 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRPC5Q9UL62 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRPC5Q9UL62 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRPC5Q9UL62 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRPC5Q9UL62 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRPC5Q9UL62 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRPC5Q9UL62 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRPC5Q9UL62 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRPC5Q9UL62 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TRPC5Q9UL62 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms