Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1BQ9UEU0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VTI1BQ9UEU0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTI1BQ9UEU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms