Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGC1AQ9UBK2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms