Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CC2D2AQ9P2K1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CC2D2AQ9P2K1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
CC2D2AQ9P2K1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC44.35■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
CC2D2AQ9P2K1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
CC2D2AQ9P2K1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CC2D2AQ9P2K1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CC2D2AQ9P2K1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms