Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS18Q9P253 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS18Q9P253 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms