Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CABP1Q9NZU7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CABP1Q9NZU7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CABP1Q9NZU7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CABP1Q9NZU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms