Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH8Q9NYR8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH8Q9NYR8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.8 ms