Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR1Q9C0D0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR1Q9C0D0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms