Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACSIN1Q9BY11 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PACSIN1Q9BY11 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN1Q9BY11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms