Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM208Q9BTX3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM208Q9BTX3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM208Q9BTX3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms