Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERPUD2Q9BSE4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HERPUD2Q9BSE4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms