Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS3Q9BRX5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GINS3Q9BRX5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GINS3Q9BRX5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms