Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC50A1Q9BRV3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC50A1Q9BRV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.3 ms