Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LARP6Q9BRS8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP6Q9BRS8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP6Q9BRS8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP6Q9BRS8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms