Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SGIP1Q9BQI5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SGIP1Q9BQI5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SGIP1Q9BQI5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms