Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRG3Q99928 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms