Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP295NLQ96MC4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP295NLQ96MC4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms