Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC42Q96M95 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC42Q96M95 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC42Q96M95 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms