Protein–RNA interactions for Protein: Q96D53

COQ8B, Atypical kinase COQ8B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ8BQ96D53 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COQ8BQ96D53 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ8BQ96D53 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COQ8BQ96D53 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ8BQ96D53 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ8BQ96D53 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ8BQ96D53 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ8BQ96D53 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ8BQ96D53 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ8BQ96D53 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ8BQ96D53 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms