Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3KBP1Q96B97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms