Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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TRIM63Q969Q1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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TRIM63Q969Q1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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TRIM63Q969Q1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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TRIM63Q969Q1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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TRIM63Q969Q1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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TRIM63Q969Q1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM63Q969Q1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRIM63Q969Q1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRIM63Q969Q1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRIM63Q969Q1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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TRIM63Q969Q1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM63Q969Q1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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