Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2H4Q92759 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2H4Q92759 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms