Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA1Q8N8W4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms