Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDB1Q86U70 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDB1Q86U70 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms