Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTU1Q7Z7A3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTU1Q7Z7A3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTU1Q7Z7A3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms