Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6M3

MILR1, Allergin-1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MILR1Q7Z6M3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MILR1Q7Z6M3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MILR1Q7Z6M3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MILR1Q7Z6M3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms