Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
STRCQ7RTU9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
STRCQ7RTU9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
STRCQ7RTU9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
STRCQ7RTU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms