Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR88Q6ZMY6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms