Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC62Q6P9F0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC62Q6P9F0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC62Q6P9F0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms