Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3HQ6NTF7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3HQ6NTF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
APOBEC3HQ6NTF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms