Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNYL2Q5T2Q4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNYL2Q5T2Q4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNYL2Q5T2Q4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms