Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NHSL1Q5SYE7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NHSL1Q5SYE7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NHSL1Q5SYE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NHSL1Q5SYE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NHSL1Q5SYE7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NHSL1Q5SYE7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NHSL1Q5SYE7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms