Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VARS2Q5ST30 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VARS2Q5ST30 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARS2Q5ST30 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VARS2Q5ST30 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms