Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO48Q5FWF7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO48Q5FWF7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO48Q5FWF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO48Q5FWF7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO48Q5FWF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO48Q5FWF7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO48Q5FWF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO48Q5FWF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO48Q5FWF7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO48Q5FWF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO48Q5FWF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms