Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFT2D3Q587I9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms