Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD4Q53EL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD4Q53EL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCD4Q53EL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms