Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A4Q4VNC1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ATP13A4Q4VNC1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A4Q4VNC1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms