Protein–RNA interactions for Protein: Q2M296

MTHFSD, Methenyltetrahydrofolate synthase domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSDQ2M296 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MTHFSDQ2M296 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MTHFSDQ2M296 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTHFSDQ2M296 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MTHFSDQ2M296 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.3 ms